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中国主要养殖罗非鱼亲缘关系的COI序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 郭奕惠 1 ; 喻达辉 1 ; 黄桂菊 2 ; 李莉好 1 ; 符云 3 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

2.上海海洋大学水产与生命学院

3.广东省淡水名优鱼类种苗繁育中心

关键词： 罗非鱼;COI基因;亲缘关系

期刊名称： 华中农业大学学报

ISSN： 1000-2421

年卷期： 2009 年 28 卷 01 期

页码： 81-85

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对中国主要养殖的尼罗、奥利亚、莫桑比克、杂交种尼奥(尼罗×奥利亚)、奥尼(奥利亚×尼罗)和红罗非鱼(莫桑比克×尼罗)的线粒体COI基因的部分序列进行了PCR扩增、克隆和测序分析,探讨罗非鱼种间亲缘关系和种类鉴别标记。6种罗非鱼中大部分个体均获得长586~708 bp的基因序列。其碱基组成GC含量为47.7%。序列分析表明,莫桑比克罗非鱼2个个体分为2个单倍型,单倍型之间的碱基差异为1个碱基,其余几种罗非鱼均只有1个单倍型。其中,尼罗和尼奥、奥利亚和奥尼的单倍型序列相同,但种间核苷酸序列差异达4.3%~7.7%。根据聚类分析结果可将这6个(杂)种分为3个组:尼罗-尼奥,红罗-莫桑比克和奥利亚-奥尼罗非鱼组,其中前2组亲缘关系较近,与后1组亲缘关系较远。表明COI可作为罗非鱼种类判别和亲缘关系分析的重要标记。

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