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半番鸭羽色相关基因均一化差减文库的构建和鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 郑嫩珠 1 ; 陈晓燕 1 ; 卢立志 2 ; 朱志明 1 ; 缪中纬 1 ; 辛清武 1 ; 陈晖 1 ; 肖天放 3 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院畜牧兽医研究所

2.浙江省农业科学院畜牧兽医研究所

3.福建农林大学动物科学学院

关键词: 半番鸭;羽色基因;双链特异性核酸酶(DSN);消减杂交;荧光定量PCR

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2012 年 45 卷 22 期

页码: 4688-4696

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分离半番鸭羽色相关基因,探索半番鸭羽色基因表达调控的分子机制。【方法】以半番鸭白羽皮肤和黑羽皮肤分别作为试验组(tester)和驱动组(driver),利用双链特异性核酸酶(duplexspecificnuclease,DSN)介导的均一化消减杂交方法,构建半番鸭羽色相关基因消减cDNA文库,同时采用实时荧光定量PCR方法对文库质量进行验证。【结果】①从文库中随机选取144个阳性克隆进行测序分析,最终共获得64条有效序列,平均长度为1 031 bp;经BLAST比对发现,21条具有同源序列,且同源性平均为92.8%;43条未找到匹配序列,推测可能为羽色相关新基因;②Geneontology功能分析表明,已知基因参与信号转导、细胞结构、物质转运、细胞凋亡、细胞与机体防御、转录与表达调控等诸多生物学过程,并且与色素形成和转运存在不同程度的相关性。【结论】经实时荧光定量PCR鉴定后,所建文库质量良好,能够有效地富集白羽皮肤特异表达基因。

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