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三裂叶薯GRF转录因子家族全基因组鉴定和表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张海 1 ; 陈昌健 1 ; 吴胜男 1 ; 王忠伟 1 ; 李闯 1 ; 郭晓威 1 ; 姚琪 1 ; 王庆峰 1 ; 袁宝祺 1 ; 孙凯 1 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院经济植物研究所

关键词: 三裂叶薯;GRF;生物信息;进化分析

期刊名称: 种子

ISSN: 1001-4705

年卷期: 2025 年 44 卷 009 期

页码: 48-55

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 生长调控因子(GRF)在植物的生长发育、信号转导和胁迫响应中起着重要的调控作用.利用生物信息学方法,对三裂叶薯的GRF成员进行全基因组鉴定,并对其系统发育关系、基因结构、启动子顺式作用元件、共线性关系以及表达特征进行了分析.结果表明,三裂叶薯含有19个GRF家族成员,不均匀地分布在11条染色体上.根据其蛋白结构和系统发育特征,将19个ItbGRFs分为4组.物种间共线性分析发现,15个ItbGRFs与IbGRFs具有共线性.表达模式分析发现,多数ItbGRFs基因在叶中表达量较高且多数ItbGRFs基因对逆境胁迫均有响应.

  • 相关文献

[1]三裂叶薯KUP/HAK/KT基因家族的全基因组鉴定和表达模式分析. 吴胜男,孙凯,张海,刘峰,王凤. 2023

[2]高亲和力玉米转磷蛋白基因B103-Zm5473电子克隆及其生物信息学分析. 曲文利,李君,孙盼盼,吴委林,郑大浩. 2017

[3]大豆2S清蛋白基因生物信息学分析. 王迪,邱红梅,王曙明,高淑芹,马晓萍,王洋,郑大浩,王跃强. 2019

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