文献类型： 中文期刊
作者： 奥娜 1 ; 赵泓 2 ; 裴雁曦 1 ; 王永勤 2 ;
作者机构： 1.山西大学生命科学学院
2.北京市农林科学院蔬菜研究中心
关键词： 大葱;蜡质;Af CER1;基因克隆;表达分析
期刊名称： 山西农业科学
ISSN： 1002-2481
年卷期： 2016 年 44 卷 05 期
页码： 569-574+582
摘要： 基于大葱RNA-seq转录组数据库中蜡质相关基因Af CER1的序列设计引物,利用RT-PCR(Reverse transcription-polymerase chain reaction)和RACE(Rapid amplification of c DNA ends)技术获得Af CER1(Allium fistulisum CER1)的全长c DNA序列,并通过生物信息学手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析Af CER1基因在大葱野生型和突变型植株中的空间表达模式。结果表明,Af CER1基因全长为2 144 bp,包含一个1 857 bp完整的开放阅读框(ORF),编码618个氨基酸。蛋白序列比对分析表明,Af CER1与其他物种的CER1具有相似的结构域:脂肪酸羟化酶结构域和WAX2-C结构域。由RT-PCR的结果可知,Af CER1基因在大葱的根、叶鞘、叶片等部位均有表达,且在野生型和突变型植株中的表达量有差异。Real-time PCR分析表明,在大葱的根和叶鞘及刚见光的叶片中,Af CER1在突变型植株中的表达量相对野生型少;而在见光较多的叶片部位,Af CER1在突变型植株中的表达量却比野生型多。研究可为大葱蜡质合成的分子机制提供理论基础。
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