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菊芋SSR-PCR反应体系优化及3个品种的分子鉴别

文献类型： 中文期刊

作者： 任鹏鸿 1 ; 韩睿 1 ; 马胜超 1 ; 李莉 1 ;

作者机构： 1.青海省农林科学院菊芋研发中心青海省蔬菜遗传与生理重点实验室

关键词： 菊芋;SSR-PCR;优化;引物筛选;分子鉴别

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2013 年 26 卷 06 期

页码： 2441-2446

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究通过单因子优化试验和L16(45)正交试验设计的方法,对菊芋SSR-PCR反应体系进行优化。结果表明,20μl最佳反应体系:10×PCR扩增缓冲液,2.5 mmol/L Mg2+,0.20 mmol/L dNTPs,0.30μmol/L正反引物,0.2 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA。利用该优化体系,从100个SSR引物组合中筛选出12个清晰且多态性高的引物组合对3个品种的菊芋DNA序列进行扩增,得到58个位点,其中多态性位点39个,多态率为67.2%;建立3个菊芋品种分子识别卡,用2对引物组合的6个多态性位点即可将其分开。本研究为后续应用SSR分子标记技术对菊芋进行种质资源分子遗传学方面的研究提供依据。

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