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海南稻作区稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异监测与多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 危艺可 1 ; 王倩 1 ; 吴伟怀 2 ; 陆英 2 ; 贺春萍 2 ; 梁艳琼 2 ; 易克贤 2 ;

作者机构: 1.海南大学植物保护学院热带农林生物灾害绿色防控教育部重点实验室

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业农村部热带作物有害生物综合治理重点实验室

关键词: 稻瘟病菌;AvrPik等位基因;多样性

期刊名称: 植物保护

ISSN: 0529-1542

年卷期: 2023 年 002 期

页码: 57-64

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 海南省地处热带。由于具有国内其他地区无可比拟的光温资源优势,每年有大量的水稻材料在南繁区繁育与种植,给稻瘟病菌的变异及传播带来了极大的便利。自20世纪70年代以来,Pik等位基因已被广泛地用作水稻抗稻瘟病育种的主要抗源。为了解海南稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异及多样性,本研究从海南稻作区采集穗茎瘟病样,通过单孢分离获得100株稻瘟病菌株。利用AvrPik基因特异性引物扩增病原菌DNA,所得PCR产物经克隆、测序后与参考序列进行比对分析。结果从100株菌株中鉴定出AvrPik_A、AvrPik_B、AvrPik_D、AvrPik_E和AvrPik_F共5种等位基因类型。其中AvrPik_D类型最多,出现频率为50.00%;其次为AvrPik_E类型,出现频率为32.08%;第三为AvrPik_B类型,出现频率为8.49%。在AvrPik等位基因核苷酸多样性方面,非信号肽区域多样性要明显高于信号肽区域。就群体受到的选择压而言,南繁种植区与常规种植区的稻瘟病菌群体的Ka/Ks值均大于1,分别为2.703 1和1.236 6,表明,无论是南繁区还是常规种植区,AvrPik等位基因均受到了强烈的正选择压,且南繁区群体受到的选择压更强。上述5种不同基因型的代表菌株中菌株20MG48 (AvrPik_F)长势最快,其产孢量却最少。本研究初步明确了海南稻作区AvrPik等位基因的群体结构,为本稻作区抗性品种的布局以及抗瘟育种计划提供参考。

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