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侵染胡椒的黄瓜花叶病毒海南分离物全序列分析及亚组鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 刘培培 1 ; 车海彦 2 ; 曹学仁 2 ; 杨毅 2 ; 罗大全 2 ;

作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： 胡椒;黄瓜花叶病毒;海南分离物;核酸;全序列分析

期刊名称： 热带生物学报

ISSN： 1674-7054

年卷期： 2016 年 7 卷 02 期

页码： 265-269

摘要： 对侵染海南胡椒的3个黄瓜花叶病毒分离物(CMV-WN1,CMV-DA,CMV-FT)的全序进行克隆和分析。CMV-WN1,CMV-DA,CMV-FT分离物RNA1全长分别为3 361,3 360,3 359个核苷酸(nt),编码1a蛋白;RNA2全长分别为3 044,3 048,3 046 nt,编码2a和2b蛋白;RNA3全长分别为2 217,2 224,2 216 nt,编码3a和CP蛋白。序列一致性比较结果表明,CMV-WN1,CMV-DA,CMV-FT的RNA1,RNA2,RNA3均与CMV亚组IB CMV-SD序列一致性最高,编码的所有蛋白的氨基酸序列一致性也均与CMV-SD序列一致性最高,其中除了2b氨基酸序列一致性低于90%外,其他蛋白的氨基酸序列的一致性均高于93.5%。RNA3的5'NTR结构分析以及RNA3 5'NTR核苷酸序列和CP氨基酸序列系统进化树分析结果表明CMV-WN1,CMV-DA及CMV-FT均属CMV IB亚组。CP系统进化树中CMV-WN1,CMV-FT与云南胡椒分离物CMV-YNP聚成一簇,而CMV-DA与海南胡椒分离物CMV-HNP独立形成另一个分支。

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