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高效、新T-DNA侧翼序列分离技术——Actail-PCR

文献类型: 中文期刊

作者: 杨立勇 1 ; 刘灶长 1 ; 周立国 2 ; 罗华程 2 ; 罗利军 1 ;

作者机构: 1.上海市农业生物基因中心/作物遗传改良国家重点实验室种质资源分室

2.华中农业大学

关键词: T-DNA;侧翼序列;TAIL-PCR;Actail-PCR

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2009 年 42 卷 04 期

页码: 1447-1451

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】建立一种有效分离T-DNA插入突变体侧翼基因组序列的方法。【方法】分离侧翼的目标基因组序列是利用T-DNA标签法研究植物功能基因组学的一个关键步骤,笔者发展稳定高效的Actail-PCR分离技术。该技术一侧引物来自于T-DNA载体,另一侧引物为一个复性控制引物。复性控制引物在3'端为一个14bp的随机简并引物,在5'端非目标尾部序列接上一个通用引物,中间由5个多聚脱氧次黄嘌呤核苷(poly(dI))连接。【结果】Actail-PCR技术将随机简并引物重新编辑成复性控制引物,在40℃的低严谨条件下,3'端的随机简并引物可以与T-DNA插入突变体的侧翼目标区段随机的结合,扩增得到目标片段,随后利用5'端的通用引物与T-DNA载体上的巢式引物依次组合,在65℃(10个循环后逐步降温至58℃)的高严谨条件下逐步扩增特异片段,同时抑制非特异性扩增,可以显著提高目标片段的扩增效率,减少假阳性。【结论】相对传统的TAIL-PCR,Actail-PCR技术可以更高效地分离T-DNA插入突变体的侧翼基因组序列。

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