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木薯NHX基因家族鉴定及特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨仕梅 1 ; 谢恩俊 1 ; 罗春芳 1 ; 饶萍 1 ; 欧珍贵 1 ; 杨龙 1 ;

作者机构: 1.贵州省亚热带作物研究所/喀斯特山区作物基因资源与种质创新重点实验室

关键词: 木薯;NHX家族;系统进化;保守结构;蛋白互作;基因鉴定

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2024 年 008 期

页码: 19-26

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】鉴定木薯NHX基因家族成员并分析特征,为研究木薯耐盐新种质和挖掘木薯抗逆特性基因具有重要意义。【方法】基于全基因组水平上对木薯NHX基因家族进行鉴定,对其系统进化树、蛋白理化性质、保守结构、保守基序、共线性、蛋白互作等进行分析。【结果】在木薯中共鉴定到9条MeNHX基因(MeNHX1~MeNHX9),分为3个亚族,且不均匀地分布在7条染色体上,其中,染色体Chr03和Chr15中均包含2条MeNHX基因,染色体Chr01、Chr08、Chr09、Chr10和Chr17均只有1条MeNHX基因。MeNHX蛋白有520~1 157个氨基酸,其相对分子质量为58.09~128.21 kDa,理论等电点为5.63~9.11;为两性蛋白,不稳定系数为34.60~41.34;为疏水性蛋白,其GRAVY为0.094~0.595。9条MeNHX基因均含有典型的Na+/H+保守结构域,木薯NHX存在多个共线性区块,进化压力Ka/Ks值均小于1,主要受纯化选择作用;含有光响应、生物胁迫及非生物胁迫作用相关元件MeNHX基因同多条离子通道基因存在蛋白互作关系。【结论】MeNHX基因在木薯受到光、生物胁迫和非生物胁迫时参与生长发育过程,以适应其环境变化。

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