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基于RNA-Seq分析褪黑激素对绒山羊皮肤基因表达的影响

文献类型： 中文期刊

作者： 丽春 1 ; 付绍印 1 ; 王建蒙 1 ; 王位 1 ;

作者机构： 1.内蒙古民族大学动物科学技术学院;内蒙古自治区农牧业科学院;内蒙古ATCG生物信息研究所;内蒙古农业大学动物科学学院

关键词： 褪黑激素;绒山羊;转录组;差异表达基因

期刊名称： 畜牧与饲料科学

ISSN： 1672-5190

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 26-30

摘要： 为了研究褪黑激素(melatonin,MT)对绒山羊皮肤毛囊基因表达的影响,筛选与皮肤毛囊发育相关的重要基因,选取处于皮肤毛囊发育生长起始点(5月)的内蒙古绒山羊罕山型个体6只,分别作为埋植组(皮下埋植MT,n=3)和对照组(不埋植MT,n=3),以绒山羊个体皮肤组织为试验材料,对其进行RNA-Seq测序,利用生物信息学方法对转录组数据进行分析,在测序数据质量控制的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析。结果表明,共筛选获得了462个在埋植组与对照组中差异表达的基因,其中,上调表达208个,下调表达254个;KEGG富集性分析表明差异表达基因主要参与:代谢途径、不饱和脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢、癌症信号通路、鳞状细胞癌信号通路、黑色素合成、Wnt信号通路以及补体和凝血级联反应等,Wnt信号可能在褪黑激素调控皮肤毛囊发育中发挥重要作用。研究结果为进一步阐明褪黑激素影响毛囊生长的分子机理提供了依据。

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