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大豆核孔蛋白GmNup96基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 纪丹丹 1 ; 肖龙 1 ; 孙培元 2 ; 刘春燕 3 ; 傅永福 4 ; 陈庆山 1 ;

作者机构： 1.东北农业大学农学院

2.黑龙江省农业科学院齐齐哈尔分院

3.黑龙江省农垦科研育种中心

4.中国农业科学院作物科学研究所

关键词： 大豆;Gm Nup96;克隆;生物信息学分析

期刊名称： 大豆科学

ISSN： 1000-9841

年卷期： 2016 年 35 卷 05 期

页码： 736-741

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从大豆品种天隆1号的叶片中克隆Gm Nup96基因的c DNA序列,对其编码的氨基酸序列、蛋白质理化性质、一级结构、二级结构、亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果表明:Gm Nup96基因编码1 022个氨基酸,为具有一定亲水能力的酸性蛋白,不具有信号肽,相对分子量为116.199 7 k Da;二级结构预测结果显示,Gm Nup96序列存在α-螺旋(46.87%)、无规则卷曲(26.32%)、延伸链(17.03%)和β-转角(9.78%),并无其它二级结构;系统进化树分析表明,大豆Gm Nup96基因与野生大豆、芸豆、绿豆、红小豆之间的亲缘关系更近。

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