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鳗鲡疱疹病毒实时荧光重组酶辅助扩增(RAA)检测方法的建立及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 陈曦 1 ; 杨金先 1 ; 葛均青 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院生物技术研究所

关键词: 鳗鲡疱疹病毒(AngHV);实时荧光RAA;快速检测

期刊名称: 大连海洋大学学报

ISSN: 2095-1388

年卷期: 2024 年 002 期

页码: 234-240

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为建立鳗鲡疱疹病毒(Anguillid herpesvirus, AngHV)的实时荧光重组酶辅助扩增(recombinase-aided amplification, RAA)检测方法,根据AngHV的ORF95基因序列设计引物和探针,优化反应温度,确定反应时间,并应用该方法对采集的临床样品进行检测。结果表明:本研究中建立的实时荧光RAA检测方法的最佳反应温度为39℃,反应时间为20 min;实时荧光RAA检测方法的灵敏度、特异性及重复性评价显示,RAA检测AngHV的最低检测量为1×10~2 copies/μL,可特异性地检测AngHV,与美洲鳗鲡腺瘤病毒(American eel adomavirus, AEAdoV)、蛙虹彩病毒(Rana grylio virus, RGV)、鲤疱疹病毒(Koi herpesvirus, KHV)和对虾白斑综合征病毒(White spot syndrome virus, WSSV)均无交叉反应;实时荧光RAA检测方法的组内和组间变异系数均小于5%,表明实时荧光RAA检测方法灵敏度高、特异性强和重复性好;应用该方法对采集的25份临床样品进行检测显示,实时荧光RAA检测方法与qPCR方法的检出率一致,均为92%,高于普通PCR的检出率(76%)。研究表明,本研究中所建立的鳗鲡疱疹病毒实时荧光重组酶辅助扩增RAA检测方法快速、灵敏、可靠、准确,可用于AngHV的临床快速检测和流行病学调查。

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