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正交优化芒果SRAP扩增体系及引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 应东山 1 ; 罗海燕 1 ; 王明 1 ; 李莉萍 1 ; 王琴飞 1 ; 朱敏 1 ; 陈业渊 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 芒果;SRAP;正交设计;体系优化

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2014 年 35 卷 04 期

页码: 89-94

收录情况: CSCD

摘要: 利用正交实验设计,对芒果SRAP-PCR反应的5因素(Mg2+、dNTPs、模板DNA、引物和Taq DNA聚合酶)4水平的扩增效果进行研究,确立适合芒果SRAP-PCR反应的最佳体系。总体积25μL的SRAP-PCR优化的最佳反应体系中含有:2.5μL 10×buffer、20 ng模板DNA、2.5 mmol/L Mg2+、0.2 mmol/L dNTPs、0.4μmo1/L Primer、Taq DNA聚合酶1.5 U。并运用该体系从153对引物组合中初步筛选出50对SRAP引物组合。建立的SRAP标记可为芒果遗传多样性、分子标记及辅助育种等提供研究基础。

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