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基于表型性状与SSR分子标记的木薯种质资源遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 丘鸿 1 ; 王明 2 ; 肖鑫辉 2 ; 李开绵 2 ; 叶剑秋 2 ; 应东山 2 ; 杨延青 3 ; 孟俊霖 3 ; 袁爱娟 3 ; 朱莹 1 ;

作者机构: 1.海南大学热带农林学院

2.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/农业农村部木薯种质资源保护与利用重点实验室

3.云南农业大学热带作物学院

关键词: 木薯;表型性状;SSR荧光标记;聚类分析;遗传多样性分析

期刊名称: 南方农业学报

ISSN: 2095-1191

年卷期: 2025 年 56 卷 008 期

页码: 2490-2500

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分析114份木薯种质资源的遗传多样性,为木薯种质资源保存、评价与利用提供理论参考。【方法】对114份国内外木薯种质的株高、主茎高、节间长、株型、单株块根数、主茎粗、主茎外皮颜色、主茎内皮颜色、块根表皮等12个表型性状进行遗传多样性分析,并结合SSR荧光分子标记和毛细管电泳方法,评估木薯遗传多样性水平。【结果】12个表型性状的变异系数为15.73%~81.74%,平均为39.86%,其中单株鲜薯重的变异系数最大,主茎粗的变异系数最小;12个表型性状的Shannon-Wiener多样性指数为0.5671~2.0059,平均为1.4202,表明供试种质的遗传多样性较高。从12个表型性状中初步筛选出变异系数和Shannon-Wiener多样性指数较高的4个表型性状,分别为主茎高、单株鲜薯重、主茎粗、主茎外皮颜色。基于12个表型性状的聚类结果显示,114份木薯种质在欧式距离为20时被分为六大类,Ⅰ~Ⅲ类分别包含62、38和5份种质,第Ⅳ、Ⅴ和Ⅵ类均包含3份种质。通过28对SSR核心引物对114份木薯种质进行PCR扩增,结果显示,等位基因数(Na)为168个,每对引物检测到的Na为3~14个,平均为6个;有效等位基因数(Ne)为1.5777~7.1136个,每对引物平均检测到的Ne为3.1217个;香农指数(I)为0.6418~2.1958,平均为1.2712;观测杂合度(Ho)为0.2280~0.8070,平均为0.5877;期望杂合度(He)为0.3661~0.8594,平均为0.6444;多态性信息含量(PIC)为0.3205~0.8472,平均为0.5978,表明114份木薯种质资源具有较高的遗传多样性。基于SSR分子标记的聚类结果显示,114份木薯种质分为九大类群,Ⅰ~Ⅸ类群分别包含1、1、13、4、11、7、9、15、53份种质。表型性状聚类结果与SSR分子标记聚类结果不一致,均未表现出明显的地理来源规律。【结论】主茎高、单株鲜薯重、主茎粗和主茎外皮颜色是木薯种质资源鉴定和核心种质筛选的重要表型性状,可用于木薯种质资源评价、品种创新和优良种质筛选。114份木薯种质具有较高的遗传多样性,筛选出的28对SSR核心引物能有效分析木薯的遗传多样性,可用于鉴定种质间的亲缘关系。

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