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番茄CCCH类锌指蛋白家族的鉴定及其表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李贤国 1 ; 戴麒 1 ; 王泽鹏 1 ; 陈兆龙 1 ; 闫会转 2 ; 李宁 1 ;

作者机构: 1.新疆农业科学院园艺作物研究所

2.新疆农业大学园艺学院

关键词: CCCH;番茄;生物信息学;表达分析

期刊名称: 中国农业科技导报(中英文)

ISSN: 1008-0864

年卷期: 2025 年 27 卷 001 期

页码: 80-95

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: CCCH(C3H)型锌指蛋白是进化上保守的RNA结合蛋白质,主要与DNA和RNA结合来调控基因表达,不仅参与植物的生长发育和激素调控过程,同时也响应生物和非生物胁迫。运用生物信息学方法,在番茄(Solanum Lycopersicum)中鉴定出47个SlC3H基因,不均匀地分布在12条染色体上,主要定位于细胞核中。根据系统进化树将其分为3个亚族(Ⅰ~Ⅲ)。共线性分析发现,SlC3H基因家族存在基因复制现象,表明在进化过程中SlC3H基因可能通过复制进行家族成员扩增。番茄SlC3H基因含有1~14个外显子,其启动子区域存在与激素和非生物胁迫响应的元件。Ka/Ks分析表明,SlC3H基因家族成员和C3H基因在进化过程中经历了强烈的进化选择。qRT-PCR分析发现,在盐胁迫下,SlC3H基因家族有一半以上的基因表达上调,其中SlC3H1在8 h时表达量最高,是0 h的30倍;用0.1 mol·L-1 2,4-表油菜素内酯(2,4-epibrassinolide,EBR)处理后所有SlC3H基因在绿熟期都表达上调,表达量是对照组的8~150倍,尤其是SlC3H28在其他时期表达量几乎为0,但在绿熟期其表达量是对照组的150倍,推测EBR对果实绿熟期的发育有促进作用。上述研究结果为进一步揭示番茄C3H基因家族在响应非生物胁迫以及果实发育中的功能提供了参考依据。

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