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芝麻八氢番茄红素脱氢酶基因SiPDS的克隆与序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 于沐 1 ; 文艺 2 ; 赵辉 2 ; 苗红梅 2 ; 刘红彦 2 ;

作者机构： 1.河南省农业科学院植物保护研究所

2.河南省农业科学院植物保护研究所;农业部华北南部农作物有害生物综合治理重点实验室;河南省农业科学院芝麻研究中心

关键词： 芝麻;八氢番茄红素脱氢酶基因(SiPDS);序列分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 03 期

页码： 589-594

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 来自芝麻的八氢番茄红素脱氢酶基因(phytoene desaturase gene,PDS)的分离鉴定尚未见报道。本研究根据已报道植物PDS基因的氨基酸保守区,设计简并引物,扩增出编码芝麻新蔡选抗PDS基因c DNA的中间片段。利用电子克隆技术,从芝麻EST数据库中比对得到一条高度同源的序列,并通过RT-PCR方法,从新蔡选抗成功克隆了八氢番茄红素脱氢酶基因的c DNA,命名为Si PDS(Gen Bank登录号:KJ191121)。c DNA序列全长2 273 bp,开放阅读框长度为1 743 bp,编码580个氨基酸。根据克隆获得的全长c DNA序列设计引物,从新蔡选抗DNA中克隆获得Si PDS基因的全长DNA,长度为5 592 bp,转录区包括14个外显子和13个内含子。序列分析表明,Si PDS与其他植物的PDS蛋白序列高度相似;系统进化树分析表明,芝麻Si PDS与黄芩的亲缘关系最近。Si PDS基因可以用作植物病毒诱导的基因沉默载体的内源检测基因,在利用基因工程技术改良芝麻农艺性状方面具有较大的应用价值。

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