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鲫Carassius auratus基因组中多拷贝瘦素基因的克隆与序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王乐 1 ; 程磊 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 鲫;瘦素基因;基因克隆;序列分析

期刊名称: 水产学杂志

ISSN: 1005-3832

年卷期: 2019 年 005 期

页码: 18-24

摘要: 利用同源扩增方法克隆得到鲫Carassius auratus基因组中四个不同拷贝的瘦素基因(Leptin,Lep),依据系统进化分析结果分别命名为Lepa1、Lepa2、Lepb1和Lepb2.鲫Lep基因的四个亚型彼此间序列变异较大,但基因结构十分保守,均只有2个外显子和1个内含子.四个亚型Lep基因翻译产物的氨基酸序列相似性也较低,预测的蛋白质高级结构十分保守.鲫瘦素及编码基因的这些特点与已知的其他脊椎动物一致.分析结果显示,脊椎动物的Lep基因聚为3类,真骨鱼类的Lepa与Lepb各自分别聚类,以四足动物为主的其他脊椎动物Lep基因聚为一类,支持真骨鱼类较四足动物多经历了一轮基因组加倍的观点.鲤Cyprinus carpio和鲫基因组中均具四个Lep基因亚型,且亚型间序列相似性更高,支持鲤、鲫起源于共同的四倍体祖先.本研究可为后续研究鲫多拷贝Lep基因的生物学功能奠定基础.

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