文献类型： 中文期刊
作者： 严佳文 1 ; 解璞 1 ; 袁启凤 1 ; 马玉华 1 ; 廖仕琴 2 ;
作者机构： 1.贵州省农业科学院果树科学研究所
2.罗甸县果业产业化发展办公室
关键词： 西番莲(Passiflora edulis);基因组;SSR
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2020 年 18 卷 024 期
页码： 8171-8177
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 西番莲是中国南方地区重要的热带水果,富含多种生物活性成分,具有较高的开发价值.本研究对'紫香1号'西番莲进行了基因组调查测序,总测序深度为134.52 ×,获得高质量数据200.94 Gb.基于K-mer分析,预测基因组大小约为1 501 Mb,重复序列含量为76.11%,杂合度0.003%,GC含量42.82%.此外,在拼接的基因组序列中鉴定了202 272个SSR位点,其中含有单核苷酸重复基元的SSR位点有123 672个,占SSR总数的61.14%,其次是含有二核苷酸重复基元的SSR(53 951,26.67%)和含有三核苷酸重复基元的SSR(18 712,9.25%).本研究结果为确定西番莲全基因组测序策略和SSR分子标记开发提供了理论依据和参考.
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