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识别NG PAM序列的Cas9变异体编辑玉米ZmSCD基因及其效率测试

文献类型: 中文期刊

作者: 钱步轩 1 ; 潘弘 2 ; 王棋 3 ; 陈子奇 3 ; 杨雅文 2 ; 许洁婷 2 ; 夏涵超 1 ; 赵仁贵 1 ; 刘相国 1 ;

作者机构: 1.吉林农业大学农学院

2.未米生物科技(江苏)有限公司

3.吉林省农业科学院(中国农业科技东北创新中心)

关键词: 玉米;SpCas9-NG;编辑效率;ZmSCD

期刊名称: 华北农学报

ISSN: 1000-7091

年卷期: 2024 年 39 卷 005 期

页码: 9-14

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了探究评估SpCas9-NG在玉米基因组编辑中的应用潜力,以叶绿素合成关键基因ZmSCD作为编辑对象,该基因缺失会使苗出现白化现象,以此直观评估编辑效率。依据SpCas9和SpCas9-NG分别识别的5′-NGG-3′和5′-NG-3′PAM序列的规则,在ZmSCD的第2和第3外显子上设计了靶点后,成功将靶点序列构建至SpCas9及SpCas9-NG敲除载体上,再利用农杆菌介导的遗传转化方法将敲除载体导入玉米自交系KN5585中,将愈伤组织培养至分化出叶片组织时,统计白化苗率,以此得出不同编辑器的编辑效率,并对白化苗提取基因组后进行测序。通过3轮遗传转化SpCas9分别获得76,125,28个愈伤组织,SpCas9-NG获得100,69,30个愈伤组织。结果显示,SpCas9的3轮遗传转化的基因编辑效率分别为14.47%,13.60%,10.71%,SpCas9-NG编辑效率分别为12.00%,10.14%,13.33%;对其白化苗测序结果显示,均在靶点附近获得重叠峰。结果表明,SpCas9-NG在玉米中的编辑效率与传统SpCas9相似,显示出同样的基因编辑能力;相比之下,SpCas9-NG具备更宽泛的PAM序列适应性,这意味着它的靶点设计能力更为灵活,允许在玉米基因组中实现更加精准和多样化的编辑。

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