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红毛丹SRAP反应体系优化及多态性标记筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 林兴娥 1 ; 周兆禧 2 ; 葛宇 2 ; 臧小平 2 ; 肖正新 2 ; 尹俊梅 2 ; 马蔚红 2 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院海口实验站

2.中国热带农业科学院海口实验站;保亭黎族苗族自治县国营农场管理局;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 红毛丹;SRAP;PCR

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2015 年 13 卷 11 期

页码： 2604-2609

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为建立成熟可靠的红毛丹SRAP-PCR扩增检测技术体系,本研究首先采用单因素实验设计,对反应体系中的DNA模板、Mg2+、d NTPs、Taq DNA聚合酶和引物浓度等5个主要影响因素,设置不同的水平梯度,筛选出适宜的因子范围;在此基础上,进一步采用L16(45)正交设计,建立了红毛丹SRAP-PCR最佳反应体系:20μL体系中包含DNA模板20 ng、d NTPs 0.25 mmol/L、引物0.6μmol/L、r Taq酶1.0 U、Mg2+2.5 mmol/L。并利用优化的反应体系,从116对SRAP引物组合中筛选出37对扩增条带清晰、产物多态性较好的引物。本研究建立的SRAP-PCR体系及筛选的引物,将为红毛丹从分子水平进行种质资源遗传多样性分析、品种指纹图谱构建等研究提供基础。

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