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上海地区水稻已知品种SSR指纹图谱库构建

文献类型： 中文期刊

作者： 邓姗 1 ; 褚云霞 1 ; 黄志城 1 ; 杨华 2 ; 顾可飞 1 ; 陈海荣 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院农产品质量标准与检测技术研究所

2.上海市农业生物基因中心

关键词： DNA指纹图谱;SSR分子标记;水稻;上海

期刊名称： 中国农学通报

ISSN： 1000-6850

年卷期： 2015 年 31 卷 03 期

页码： 7-15

收录情况： CSCD

摘要： 用24对引物构建上海地区53份水稻品种的DNA指纹图谱,为当地水稻新品种保护、遗传资源评价及亲缘关系分析提供理论依据和技术支持。结果显示,试验中共检测出109条多态性片段,变幅2~9条,平均每对引物4.5417条多态性片段,有效等位基因数为70.8187,平均每个标记2.9508个;Shannon多样性指数(Ⅰ)平均值为1.1296,变幅0.4949~1.8402;多态性信息含量(PIC)平均值为0.5415,变幅0.2656~0.8001。用24个标记建立53份材料的DNA指纹图谱,这些字符串就构成了这53份材料的"身份证号码",本试验中,各材料的分子身份证号码是唯一的;聚类分析表明,在遗传相似系数0.21处可以将53份材料分为2个类群,分别为粳稻组和籼稻组,但是组内遗传距离较近。由此可见,上海地区水稻品种的遗传多样性相对狭窄。

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