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辣椒14-3-3蛋白基因家族全基因组鉴定与表达特征分析

文献类型： 中文期刊

作者： 桑婷 1 ; 颜秀娟 1 ; 裴红霞 1 ; 高晶霞 1 ; 王学梅 1 ;

作者机构： 1.宁夏农林科学院种质资源研究所

关键词： 辣椒;14-3-3基因家族;GRF;全基因组鉴定;表达特征

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2021 年 016 期

页码： 5268-5278

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 14-3-3蛋白（GRF）基因家族通过与靶蛋白相互作用,广泛参与植物激素信号转导和生理代谢过程,在植株生长发育和逆境响应中发挥重要作用。本研究以辣椒（Capsicum annuum）为材料,利用生物信息学研究方法,鉴定得到15个辣椒14-3-3基因家族成员,命名为CaGRF1～CaGRF15。系统分析了CaGRF基因家族成员的结构、进化关系、启动子顺式作用元件、组织及冷胁迫表达,并对CaGRF蛋白互作网络进行预测。结果表明,根据进化关系CaGRF家族成员被分为ε类和非ε类,ε类CaGRF含有更多外显子和内含子;启动子序列分析发现CaGRF启动子中有多个响应激素、胁迫、光的顺式作用元件;表达分析表明CaGRF各成员在辣椒各组织和冷胁迫响应中特异性表达;蛋白互作网络预测发现CaGRF可能与氮代谢、质子转运、转录调控相关蛋白互作。本研究为深入研究辣椒14-3-3家族成员功能及调控途径提供了参考。

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