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大白菜抗根肿病基因位点CRs的KASP标记开发及应用

文献类型: 中文期刊

作者: 杨双娟 1 ; 原玉香 1 ; 赵艳艳 1 ; 魏小春 1 ; 王志勇 1 ; 赵肖斌 1 ; 张晓伟 1 ;

作者机构: 1.河南省农业科学院园艺研究所

关键词: 大白菜;根肿病;CRs基因;KASP标记

期刊名称: 园艺学报

ISSN:

年卷期: 2021 年 006 期

页码: 1094-1106

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: CRs为最近发现的1个抗根肿病基因。以连锁的4个标记作为引物,以8个抗病和8个感病大白菜材料为模板,进行PCR扩增和测序。结果发现,抗病和感病材料中存在6个序列变异位点,其中5个(A08染色体9 956 808、9 956 888、9 956 904、10 707 299和10 707 385 bp)为新的变异位点,1个(10 539 495 bp处的G/A SNP变异)与前人研究结果一致。针对4个新的变异位点(因9 956 888 bp与9 956 904 bp处变异距离很近,故后者未分析)和10 539 495 bp的变异位点设计开发出5个竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)标记Probe55K1、Probe55K2、Probe64K1、Probe64K2和Probe60K1。结果表明,设计的5个KASP标记均可有效将抗病材料和感病材料分为2组。利用标记Probe55K1和Probe64K1在包含45个抗病单株和48个感病单株的BC1P1群体中进行验证,结果发现,这2个标记在各个单株的基因型和抗病性表型一致率高达94.62%。因此,本研究中开发的KASP标记可以高效用于根肿病的分子标记辅助育种。

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