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303份甘薯地方种SSR遗传多样性与群体结构分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王娇 1 ; 戴习彬 1 ; 唐君 1 ; 赵冬兰 1 ; 张安 1 ; 周志林 1 ; 曹清河 2 ;

作者机构： 1.;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所;江苏师范大学生命科学学院

2.;江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所;江苏师范大学生命科学学院;

关键词： 甘薯;地方种;SSR;遗传多样性;群体结构

期刊名称： 植物遗传资源学报

ISSN： 1672-1810

年卷期： 2018 年 02 期

页码： 243-251

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用SSR分子标记,对我国303份甘薯地方种进行了遗传多样性和群体结构分析。进一步明确了甘薯地方种间的遗传多样性和亲缘关系,为优异资源挖掘和品种改良提供了参考。利用SSR建立研究材料的0~1数据库,通过NTSYS-pc2.10软件计算Nei72遗传距离矩阵,将遗传距离矩阵导入MEGA 6.06,计算平均遗传距离和聚类分析;并利用STRUCTURE2.3.4对303份地方种进行群体结构分析。结果表明:30对SSR引物共检测出203条多态性位点,每对引物检测到1~14条多态性条带,平均每对引物获得6.77条。303份材料的平均遗传距离为0.564,聚类分析在遗传距离为0.477处可以把303份材料分成11个类群,其中第Ⅺ类群在遗传距离为0.452处可分为3个亚群。群体结构分析将303份材料划分成了5个稳定的群体,群体结构划分与聚类有相似的结果,其中70份材料Q值小于0.6,属于混合亚群。

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