您好,欢迎访问广东省农业科学院 机构知识库!

番茄AT-hook基因家族的鉴定及胁迫条件下的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 丁丽雪 1 ; 李涛 2 ; 李植良 2 ; 徐小万 2 ; 李颖 2 ; 王恒明 2 ; 王永飞 1 ; 马三梅 1 ; 黎振兴 2 ;

作者机构: 1.暨南大学生命科学技术学院

2.广东省农业科学院蔬菜研究所

关键词: 番茄;AT-HOOK基因家族;生物信息学;基因表达;氧化胁迫

期刊名称: 植物遗传资源学报

ISSN: 1672-1810

年卷期: 2016 年 17 卷 02 期

页码: 303-315

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: AT-hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄AT-hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析。结果表明,番茄AT-hook家族包含32个成员,分为3种类型,其中类型Ⅰ含有13个成员;遗传进化分析表明番茄AT-hook基因成员与拟南芥家族基因具有相似分类。利用实时荧光定量PCR对番茄32个基因开展组织表达分析,结果表明AT-hook基因具有表达差异,主要在根和花中表达较高。氧化胁迫分析结果表明,32个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,很可能参与了番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为番茄AT-hook家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析番茄AT-hook基因的功能奠定基础。

  • 相关文献

[1]番茄HDACs家族基因在胁迫条件下的表达分析. 李涛,苏慧慧,李植良,徐小万,王恒明,李颖,黎振兴. 2015

[2]马铃薯多酚氧化酶基因家族生物信息学及表达分析. 王丽,王万兴,索海翠,胡新喜,秦玉芝,李小波,熊兴耀. 2019

[3]小豆AUX/IAA基因家族全基因组鉴定及表达分析. 罗永坚,葛蓉,刘军,李清. 2022

[4]番茄组蛋白乙酰转移酶(HAT)的全基因组鉴定与分析. 史建磊,熊自立,李涛,张海利,宰文珊. 2020

[5]番茄GRX基因家族的鉴定及表达分析. 苏慧慧,李涛,黎振兴,李植良,王永飞. 2015

[6]Ⅰ型鸭疫里默氏杆菌铁依赖抑制子RaDtxR基因的发现及生物信息学分析. 袁建丰,覃宗华,吕敏娜,吴彩艳,余劲术,孙铭飞,蔡建平. 2010

[7]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017

[8]‘航花2号’的Δ~(12)脂肪酸脱氢酶(FAD2)基因的生物信息学分析. 温世杰,李杏瑜,洪彦彬,李少雄,周桂元,陈小平,梁炫强. 2017

[9]花生赤霉素3-β-双加氧酶(AhGA3ox)基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 李海芬,鲁清,刘浩,温世杰,王润风,黄璐,陈小平,洪彦彬,梁炫强. 2024

[10]荔枝VQ基因家族鉴定及其对非生物胁迫的响应. 凡超,杨杰,陈蓉,刘伟,向旭. 2024

[11]转香蕉MaASR1基因的拟南芥株系在干旱胁迫条件下的表达谱分析. 张丽丽,徐碧玉,刘菊华,贾彩红,张建斌,金志强. 2017

[12]中泰南五味子转录组测序及生物信息学分析. 李静宇,徐友阳,蔡时可,王继华. 2022

[13]花生AT-hook家族基因的生物信息学分析. 胡冬秀,刘浩,梁炫强,吴自明,方加海. 2021

[14]巴西蕉WRKY转录因子的鉴定及其枯萎病胁迫下的表达. 贾彩红,王卓,王静毅,张建斌,金志强,徐碧玉. 2019

[15]龙眼果肉自溶相关基因DlMC4的克隆和表达分析. 谷李桃,帅良,罗焘,况梦玲,韩冬梅. 2017

[16]中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析. 衡周,叶楚,方健敏,杨静,徐小万,徐晓美,李涛,王恒明. 2023

[17]白木香AsOMT1基因的克隆与表达分析. 杨艳,朱家红,曾军,梅文莉,戴好富,彭世清. 2023

[18]海南龙血树金属硫蛋白基因DcMT2的克隆和表达分析. 丁旭坡,吴春来,彭世清,梅文莉,戴好富. 2018

[19]1株J亚群禽白血病病毒env基因克隆及生物信息学分析. 陈玫婷,郑从森,梁泽贤,林巧儿,常传哲,周俊,冯军,李林林,覃丽梅. 2023

[20]香蕉MaERF-1基因的克隆、序列分析及表达载体构建. 金志强,徐碧玉,黄东梅,胡伟,李凯,许奕. 2017

作者其他论文 更多>>