文献类型: 中文期刊
作者: 丁丽雪 1 ; 李涛 2 ; 李植良 2 ; 徐小万 2 ; 李颖 2 ; 王恒明 2 ; 王永飞 1 ; 马三梅 1 ; 黎振兴 2 ;
作者机构: 1.暨南大学生命科学技术学院
2.广东省农业科学院蔬菜研究所
关键词: 番茄;AT-HOOK基因家族;生物信息学;基因表达;氧化胁迫
期刊名称: 植物遗传资源学报
ISSN: 1672-1810
年卷期: 2016 年 17 卷 02 期
页码: 303-315
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: AT-hook蛋白家族在植物生长发育、器官构建及逆境胁迫和激素信号应答中发挥重要作用。本研究在番茄基因组范围内,利用生物信息学方法对番茄AT-hook基因家族的成员、分布、结构和功能进行分析。结果表明,番茄AT-hook家族包含32个成员,分为3种类型,其中类型Ⅰ含有13个成员;遗传进化分析表明番茄AT-hook基因成员与拟南芥家族基因具有相似分类。利用实时荧光定量PCR对番茄32个基因开展组织表达分析,结果表明AT-hook基因具有表达差异,主要在根和花中表达较高。氧化胁迫分析结果表明,32个基因受ABA、SA、盐、高温和低温诱导表达,其中部分基因显著上调或下调表达,很可能参与了番茄逆境胁迫条件下的防御应答反应。本研究结果将为番茄AT-hook家族基因的深入研究提供依据,为进一步解析番茄AT-hook基因的功能奠定基础。
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