您好，欢迎访问江苏省农业科学院 机构知识库！
江苏省农业科学院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

实时定量PCR法预测禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis基因组大小

文献类型： 中文期刊

作者： 张春燕 1 ; 李伟 2 ; 孙海燕 2 ; 邓渊钰 2 ; 张爱香 2 ;

作者机构： 1.南京农业大学

2.江苏省农业科学院植物保护研究所

关键词： 禾谷丝核菌;基因组大小;翻译延伸因子A;单拷贝;实时定量PCR

期刊名称： 微生物学通报

ISSN： 0253-2654

年卷期： 2014 年 41 卷 09 期

页码： 1917-1923

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】准确测定基因组大小是进行禾谷丝核菌Rhizoctonia cerealis全基因组序列测定和拼接的基础,本研究旨在利用实时定量PCR方法预测禾谷丝核菌的基因组大小。【方法】首先克隆了禾谷丝核菌R0301菌株翻译延伸因子A基因(tef A)的部分序列,Southern杂交明确该基因在该病菌基因组中为单拷贝。以已测序立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG1-IA融合群菌株GD118为对照,采用实时定量PCR的方法进行了禾谷丝核菌基因组大小的预测。【结果】实时定量PCR的方法可以比较准确的测定立枯丝核菌基因组的大小,研究首次预测了禾谷丝核菌的基因组大小位于32.2–36.6 Mb之间。【结论】实时定量PCR法是一种快速和简便的预测丝核菌基因组大小的方法。

  • 相关文献

[1]不同地区小麦纹枯病菌的生物学特性及种类鉴定研究. 陈健华,邢锦城,张茸茸,张旭,陈怀谷,马鸿翔. 2010

[2]江苏大麦纹枯病菌酯酶同工酶的测定. 赵桂东,李清铣. 1993

[3]江苏小麦纹枯病菌(Rhizoctonia Cerealis Vander Hoeven)CAG_1群菌株的特性和致病力分化. 潘以楼,吴汉章. 1992

[4]小麦纹枯病菌中的dsRNA及其与菌株生物学特性的相关性. 张涛,杜文珍,张春燕,陈莹,于汉寿,李伟,陈怀谷. 2015

[5]禾谷丝核菌原生质体的制备及遗传转化体系的探索. 任向荣,李伟,孙海燕,陈怀谷,于汉寿. 2013

[6]禾谷丝核菌的次生代谢产物. 陈怀谷,王裕中,陈利锋,史建荣. 2001

[7]小麦茎基部土传真菌病害的分子诊断. 杨慧勇,王兵,李飞凤,史建荣,宋玉立,杨崇良. 2008

[8]禾谷丝核菌基因组SSR标记的开发及评价. 李伟,张兴,孙海燕,邓渊钰,张爱香,马东方,陈怀谷. 2017

[9]禾谷丝核菌胞外产物对小麦抗病性的诱导作用. 陈怀谷,陈利锋,王裕中,林玲,史建荣. 2002

[10]应用real-time PCR对土壤中小麦纹枯病菌Rhizoctonia cerealis进行鉴定和定量检测. 郭英鹏,李伟,孙海燕,于汉寿,陈怀谷. 2011

[11]6种野生草莓基因组大小估算. 陈丙义,李金凤,霍恒志,万春雁,章镇. 2015

[12]基于流式细胞术的旱柳染色体倍性与基因组大小测定. 张健,王莹,马祥建,谈峰,李敏,李玉娟. 2018

[13]25份甘薯登记品种基因组大小测定. 苏一钧,王珧,戴习彬,赵路宽,张安,曹清河. 2019

[14]基于流式细胞术和K-mer分析的银缕梅属(Parrotia C.A.Mey.)植物基因组大小测定. 张云燕,安宇,林峰,马秋月,周翔宇,金亮,李朋富,王中生. 2021

[15]甘薯近缘种人工合成四倍体的倍性鉴定和减数分裂行为观察. 邓逸桐,王珧,张安,孙建英,戴习彬,孙健,唐君,曹清河. 2020

[16]3种瓣型茉莉基因组大小测定与比较. 齐香玉,陈双双,冯景,王华娣,邓衍明. 2020

[17]甘薯近缘种Ipomoea cordatotriloba基因组大小测定及高通量调查测序. 王珧,邓逸桐,戴习彬,张安,曹清河,陈艳丽. 2020

[18]基于流式细胞术和K-mer方法测定6种槭属植物基因组大小. 马秋月,王玉虓,李倩中,李淑顺,闻婧,朱璐,颜坤元,杜一鸣,解志军,李淑娴,欧阳芳群,鲁成代. 2023

[19]基于流式细胞术和基因组Survey的绣球基因组大小及特征分析. 陈双双,齐香玉,冯景,王华娣,邓衍明. 2021

[20]灰飞虱2种热激蛋白基因Hsp70的克隆、分析. 张青,陆明星,祝树德. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：江苏省农业科学院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台