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玉米高光效基因ppdk的克隆及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王重 1 ; 张跃强 1 ; 樊哲儒 1 ; 李剑峰 1 ; 赵奇 1 ; 王子霞 1 ; 海热古丽·阿不力孜 1 ; 张宏芝 1 ;

作者机构: 1.新疆农业科学院核技术生物技术研究所

关键词: 玉米;C4植物;光合作用效率;ppdk;生物信息学

期刊名称: 新疆农业科学

ISSN: 1001-4330

年卷期: 2010 年 47 卷 12 期

页码: 2354-2360

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】获得玉米(Zea mays)的丙酮酸磷酸双激酶基因(以下简称ppdk),并对其进行生物信息学分析。【方法】使用Trizol提取玉米SC704的总RNA,并用特异引物对其进行RT-PCR扩增,将得到的cDNA片段连接到pGEM-T载体后转化大肠杆菌DH5α,然后对阳性克隆进行测序,并对序列进行生物信息学分析。【结果】获得的玉米PPDK基因CDS全长2 781 bp,与玉米z561ppdk基因同源性为99%;其编码的多肽链包含926个氨基酸,与玉米PPDK同源性为97%。【结论】克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域。该基因的成功克隆为今后利用其改造C3植物的光合效率以提高粮食单产奠定了良好的基础。

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