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新疆野苹果和栽培苹果特异性SSR标记开发及应用

文献类型： 中文期刊

作者： 于少帅 1 ; 赵文霞 2 ; 姚艳霞 2 ; 淮稳霞 2 ; 覃伟权 1 ; 阎伟 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院椰子研究所

2.中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所/国家林业和草原局森林保护学重点实验室

关键词： 新疆野苹果;栽培苹果;SSR标记;遗传多样性

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2020 年 48 卷 021 期

页码： 68-73,83

收录情况： 北大核心

摘要： 根据全基因组测序已完成的栽培苹果基因组,设计、筛选针对新疆野苹果的特异性SSR引物.通过PCR扩增、基因测序筛选了15对可以在新疆野苹果和栽培苹果中扩增出稳定性高且具备多态性目的条带的特异性SSR引物;其中8对仅能在栽培苹果中扩增出特异性目的条带.15对特异性SSR引物对新疆野苹果和栽培苹果不同居群的SSR分析表明,新疆野苹果遗传多样性较为丰富,与栽培苹果不同居群分化程度较为显著,基因流水平较低.聚类分析表明,这15对特异性SSR引物可以将新疆野苹果和栽培苹果不同居群清晰区分.本研究利用新开发的SSR引物不仅可以揭示新疆野苹果和栽培苹果的遗传多样性和系统发育关系,对初步了解SSR变异位点的生物学功能以及丰富新疆野苹果和栽培苹果基因组的认识也有一定的作用,从而为更好地有效利用相关资源提供研究基础.

  • 相关文献

[1]新疆野苹果和栽培苹果遗传分化与变异特征. 于少帅,赵文霞,姚艳霞,张学超,淮稳霞. 2020

[2]糙柱花草遗传多样性SSR分析. 丁西朋,罗小燕,张龙,王文强,白昌军. 2015

[3]SSR标记及其在蔬菜育种中的应用. 罗玉娣,李建国. 2005

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