您好，欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库！
中国水产科学研究院机构知识库

全部

  • 全部
  • 标题
  • 学者
  • 机构
  • 关键词

达氏鳇(Huso dauricus)生长激素基因挖掘及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 吕伟华 1 ; 马波 1 ; 尹家胜 1 ; 徐伟 1 ; 张颖 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 达氏鳇（Huso dauricus Georgi）;生长激素基因;基因挖掘;生物信息学

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN：

年卷期： 2020 年 010 期

页码： 4457-4466

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为进一步掌握生长激素（growth hormone,GH）基因在达氏鳇繁育、生长发育、基因多态性与生长性能相关性等方面的调控机制,本研究利用RACE扩增的方法获得了达氏鳇GH基因的全长cDNA序列掌握达氏鳇GH基因序列的组成结构特点并对GH蛋白进行了生物学信息分析。结果显示达氏鳇GH基因cDNA全长序列1 016 bp 5’非翻译区（5’-UTR）为125 bp,3’非翻译区（3’-UTR）为312 bp,包含30 bp的polyA尾巴,两个"AATAAA"加尾信号分别位于PloyA上游227 bp和19 bp处。利用推测的GH蛋白的氨基酸序列进行物种内的同源性比对分析达氏鳇与俄罗斯鲟的相似度最高,为97.94%;不同物种间的系统发育进化树显示达氏鳇与人、其他哺乳动物等聚为一大支,与施氏鲟聚一小支。达氏鳇GH蛋白的生物学信息分析结果显示:GH蛋白是由214个氨基酸组成含有信号肽、无跨膜结构的不稳定亲水性蛋白质,定位于细胞外,等电点为5.44,蛋白质二级结构中以α-螺旋和无规则蜷曲为主要元件,GH蛋白质含有15个丝氨酸（Ser）磷酸化位点,4个苏氨酸（Thr）磷酸化位点3个酪氨酸（Tyr）磷酸化位点。本研究对达氏鳇生长基因GH进行了克隆,并对其进行了系统进化、蛋白理化性质、蛋白跨膜、蛋白亚细胞定位等研究,为今后深入了解GH基因在达氏鳇中的生物学功能提供理论基础。

  • 相关文献

[1]适宜浓度的维生素E促进半滑舌鳎生长激素基因的表达. 王蔚芳,向玲,王琳,黄滨,李会涛. 2020

[2]转生长激素基因鲤鱼与正常鲤鱼经济性状的比较. 闫学春,孙效文,梁利群,曹顶臣. 2002

[3]翘嘴鲌生长激素(GH)基因与侧翼区的克隆及分析. 刘士力,贾永义,蒋文枰,迟美丽,程顺,赵金良,顾志敏,傅建军. 2017

[4]大菱鲆生长激素基因cDNA的克隆、序列分析及分子系统研究. 刘滨,臧晓南,刘顺梅,张学成,雷霁霖. 2008

[5]转生长激素基因鲤的快速生长效应及传代. 孙效文,梁利群,闫学春,曹顶臣. 2002

[6]不同蛋白质源饲料中添加α-酮戊二酸对杂交鲟幼鱼肝脏谷氨酰胺含量、抗氧化能力及生长激素、胰岛素样生长因子-Ⅰ基因表达的影响. 王连生,徐奇友,陈迪,郑荣宁. 2016

[7]尼罗罗非鱼绿色荧光蛋白/GH融合表达载体的构建及其在NIH293T细胞中的表达. 王茂元,张平,邹芝英,李大宇,杨弘. 2011

[8]应用荧光原位杂交技术检测大麻哈鱼生长激素基因在超级鲤染色体上的插入位点. 耿波,梁利群,孙效文,曹鼎臣,闫学春. 2005

[9]半滑舌鳎生长激素及其受体基因的原核表达. 马骞,柳淑芳,庄志猛,唐启升. 2012

[10]基于生长激素基因cDNA序列的鲽形目鱼类系统进化分析. 刘滨. 2008

[11]急性病毒性坏死病毒魁蚶株IAP-86基因全长cDNA克隆和生物信息学分析. 张帅,王崇明,岳志芹,宋晓玲,白昌明,尹伟力,黄倢. 2015

[12]暗纹东方鲀sox9基因的克隆和组织表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,刘滨,郭正龙. 2019

[13]古菌、生命树和真核细胞的功能演化. 肖静,范陆,吴顶峰,徐雁冰,赖登训,William F.MARTIN,朱瑞新,张传伦. 2019

[14]暗纹东方鲀芳香化酶基因的结构及表达分析. 高莹莹,刘新富,胡鹏,黄滨,刘滨. 2020

[15]暗纹东方鲀抗苗勒氏管激素Ⅱ型受体基因的克隆、生物信息学及表达分析. 高莹莹,胡鹏,刘新富,黄滨,刘滨. 2019

[16]鳜鱼嗜水气单胞菌GYK1株外膜蛋白A基因的克隆及其生物信息学分析. 付小哲,方翔,李宁求,林强,潘厚军,石存斌,黄志斌,吴淑勤. 2013

[17]奥利亚罗非鱼DMRT1基因推导蛋白的结构和功能预测. 曹谨玲,陈剑杰,吴婷婷. 2009

[18]黄颡鱼MyoD基因的克隆及其表达. 梁宏伟,李忠,邹桂伟,刘小林. 2012

[19]半滑舌鳎(Cynoglossus semilaevis)Sox基因家族生物信息学分析. 高进,马佳璐,刘洋,邵长伟,贾晓东,陈松林. 2016

[20]基于“天河二号”的水产病原生物信息分析平台构建及其在水产病原分析中的应用. 方翔,李宁求,付小哲,李凯彬,林强,刘礼辉,石存斌,吴淑勤. 2015

作者其他论文 更多>>
置顶
购物车
反馈

© 京ICP备09089781号-29 主办单位：中国水产科学研究院

学术资源： 中国农业科学院 农业专业知识服务系统 农科联盟资源共建共享平台 中国农业科技文献与信息服务平台 中国农业期刊集成服务平台