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运用TRAP标记分析5个鲤群体的遗传多样性

文献类型： 中文期刊

作者： 董在杰 1 ; 曲疆奇 2 ; 苏胜彦 3 ; 梁政远 2 ; 明俊超 2 ; 袁新华 3 ; 谢庄 1 ;

作者机构： 1.南京农业大学

2.南京农业大学无锡渔业学院

3.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

关键词： 鲤;TRAP标记;遗传多样性

期刊名称： 上海海洋大学学报

ISSN： 1674-5566

年卷期： 2011 年 20 卷 02 期

页码： 179-184

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 运用TRAP标记技术,选取10个多态性较好的引物组合对荷包红鲤、黄河鲤、建鲤、兴国红鲤和黑龙江野鲤等5个鲤群体进行遗传多样性分析,其中固定引物是根据目标候选基因GHR基因的序列设计。结果表明,共扩增出168个位点,其中多态性位点134个,平均多态位点比例为80.41%,平均多态性信息含量为0.29。分子变异方差分析(AMOVA)结果显示群体内的方差贡献率达96.97%,表明各个鲤群体内存在较大的遗传变异。种群再分效应固定指数(FST=0.030 26,P<0.05)表明不同鲤群体间有显著的遗传分化。基于目标候选基因的TRAP标记对5个鲤群体进行聚类分析,结果表明建鲤和兴国红鲤首先聚成一类,然后黄河鲤和黑龙江野鲤聚为一类,再与荷包红鲤聚为一类。

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