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DGGE法与常规培养法对稻田蓝细菌多态性分析结果比较

文献类型： 中文期刊

作者： 宋铁英 1 ; 林智敏 1 ; 郑伟文 1 ; LOTTA Martensson 2 ; ULLA Rusmussen 2 ;

作者机构： 1.福建省农业科学院生物技术中心

2.瑞典斯德哥尔摩大学植物系

关键词： 稻田;蓝细菌;DGGE技术

期刊名称： 中国生态农业学报

ISSN： 1671-3990

年卷期： 2005 年 13 卷 03 期

页码： 140-143

收录情况： CSCD

摘要： 研究运用蓝细菌和硅藻16SrDNA特异引物,将晚季水稻生长后期稻田土壤中提取的总DNA进行PCR扩增后,以DGGE技术对PCR产物进行分析结果表明,14条DGGE带经克隆测序,经NCBI基因库比对得晚季水稻生长后期存在10种蓝细菌,包括4种Leptolyngbya、1种Chamaesiphon、1种Nostoc、1种Oscillatoria、2种Syne-chococcus和1种Chroococcidiopsis。同层不同位置土壤中蓝细菌种群亦有所不同,但每个取样点都有一些特有的蓝细菌种类。用常规方法对同一稻田土壤样品进行分离培养,根据蓝细菌鉴定图谱观察到类似Lyngbya、Oscillatori-a、Chroococcidiopsis及Nostoc的蓝细菌,但显微镜下无法准确分类。比较结果表明采用DGGE法比常规培养法能更准确进行蓝细菌多态性鉴定。

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