文献类型： 中文期刊

作者： 胡玉璐 ¹ ; 姜百灵 ² ; 陈凌 ³ ; 王海岗 ³ ; 曹晓宁 ³ ; 王瑞云 ¹ ; 乔治军 ³ ;

作者机构： 1.山西农业大学 农学院

2.山西农业大学农学院

3.山西农业大学 农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室

关键词： 黍稷;SSR;DNA条形码;DNA二维码;中国北方

期刊名称： 山西农业科学

ISSN： 1002-2481

年卷期： 2022 年 50 卷 004 期

页码： 478-485

摘要： 利用SSR标记,分析中国北方黍稷种质资源的区别与联系,根据DNA碱基的不同,制作出不同的DNA身份证,即构建字符串DNA分子身份证、条形码DNA分子身份证和二维码DNA分子身份证,为黍稷资源管理和保护提供依据.用14对高基元SSR(六碱基4对、五碱基10对)引物对8个省共20份黍稷资源进行分子身份证的构建,利用PowerMarker 3.25、PopGen 1.32软件计算遗传多样性参数,利用ID Analysis 4.0进行引物组合优化.结果表明,20份材料在10个位点共检测出等位变异10个;Shannon多样性指数(I)为0.7029(RYW7)~1.0880(RYW2),平均为0.9588;观测杂合度(Ho)为0.5000(RYW7)~0.8235(RYW12),平均为0.6866;有效等位变异(Ne)为1.6623(RYW7)~2.7923(RYW12),平均为2.4553;期望观测杂合度(He)为0.4113(RYW7)~0.6862(RYW2),平均为0.6024;多态性信息含量(PIC)为0.4886(RYW3)~0.7766(RYW8),平均为0.6298;Nei's基因多样性指数(Nei)为0.3984(RYW7)~0.6598(RYW2),平均为0.5828.