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水稻寡分蘖突变体差异表达基因的鉴定和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 殷得所 1 ; 孙小琼 2 ; 万丙良 1 ; 李进波 1 ; 邓其明 2 ; 李平 2 ; 戚华雄 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院粮食作物研究所

2.四川农大高科种业有限责任公司

关键词： 水稻;分蘖突变体;mRNA差异显示

期刊名称： 湖北农业科学

ISSN： 0439-8114

年卷期： 2009 年 48 卷 08 期

页码： 1793-1795+1799

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 一般认为分蘖由QTL控制,对植物侧生组织的研究表明,水稻分蘖的形成可能受激素的控制。以寡分蘖突变体G069与广亲和材料"02428"构建的1对近等基因系02428-ftl为对象,采用RNA差异显示技术分析了此对近等基因系在分蘖前期的基因差异表达。经过片段回收,反式Northern杂交(Re-verse northern blotting)和测序分析,分离得到一个在"02428"中强势表达的基因片段。生物信息学分析表明,该片段与水稻的cDNA和mRNA以及基因组序列高度相似,但没有同源的氨基酸序列,说明该片段处于非编码区;电子延伸序列与多个水稻多肽序列高度同源,含有一个明显的蛋白激酶作用域,但未发现与已报道的基因同源。推测为一未知的调控蛋白。

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