文献类型: 中文期刊
作者: 张国莉 1 ; 周倩怡 1 ; 余小奎 1 ; 赵胤泽 1 ; 张祥林 2 ; 田洁 1 ;
作者机构: 1.青海大学农林科学院
2.青海省海东市乐都区蔬菜技术服务中心
关键词: 大蒜;水通道蛋白;基因家族;生物信息学分析;干旱胁迫
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2024 年 22 卷 024 期
页码: 8034-8047
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 水通道蛋白(AQPs)作为植物中普遍存在的蛋白,不仅可以控制水的进出,还可运输其他多种物质,调控其他生理功能,是一类重要的多功能蛋白。本研究基于大蒜转录组数据,筛选并鉴定AsAQPs基因,根据进化树进行分类和命名,预测AsAQPs蛋白的理化性质、跨膜结构域、保守结构域、亚细胞结构、二级结构、三级结构以及分析干旱胁迫下叶片中AsAQPs的表达模式。结果表明:转录组数据中共鉴定出84个AsAQPs,分为PIPs、NIPs、TIPs和SIPs 4个亚族。编码蛋白质的氨基酸数目在41~327之间,分子量约为4.53~35.70 kD,等电点为4.20~11.31;亚细胞定位预测结果显示大部分AsAQPs定位于质膜、叶绿体、液泡,少部分定位于内质网、高尔基体、线粒体和过氧化氢体;二级结构显示主要为α-螺旋和无规卷曲,三级结构为典型的四聚体。从AsAQPs中找出15个具有6个典型跨膜结构域的水通道蛋白基因,并进行干旱胁迫的表达分析,AsNIP2-1、AsPIP1-3、AsPIP2-25、AsTIP1-2、AsTIP4-1在胁迫6 d时表达量达到峰值,AsPIP2-20在叶片中一直维持高水平表达,是叶中重要的运输水蛋白基因家族成员之一。本研究通过对AsAOPs基因家族进行生物信息学分析及干旱胁迫表达分析,明晰AsAQPs的结构特征及胁迫响应模式,对进一步研究大蒜水通道蛋白的运输机制和在抵抗不良环境方面的作用具有重要的指导意义。
- 相关文献
[1]干旱胁迫下大蒜叶绿素合成基因家族鉴定分析. 王紫彤,周倩怡,田洁. 2022
[2]大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析. 隋淑梅,黄思杰,田洁. 2023
[3]大蒜糖转运蛋白基因AsSWEET14克隆与胁迫表达分析. 郑晓雯,徐庭亮,田洁. 2023
[4]干旱胁迫下大蒜果聚糖代谢关键酶基因的表达分析. 边海燕,钟启文,黄思杰,王丽慧,杨世鹏,田洁. 2018
[5]干旱胁迫对大蒜生长及生理特性的影响. 田萌,王丽慧,钟启文,边海燕,田洁. 2018
[6]干旱胁迫下大蒜幼苗的代谢组学分析. 田洁,周倩怡,铁原毓,孙海宏,黄思杰. 2024
[7]大蒜干物质积累与硒的吸收、分配及累积特性研究. 张荣. 2012
[8]甘蓝型油菜转录因子SRS基因家族的全基因组鉴定及表达分析. 王龙,张永顺,王红艳,肖麓. 2024
[9]大蒜农艺性状与鳞茎果聚糖含量相关性分析. 田萌,王丽慧,杨世鹏,钟启文,田洁. 2018
[10]有机肥替代化肥对大蒜产量、品质及土壤养分的影响. 王明文,张洋,胥婷婷,许显虹,张荣. 2021
[11]栽培措施对乐都紫皮蒜干物质积累与转运的影响. 方云花,王丽慧,马元鑫,谭龙,李莉. 2012
[12]乐都紫皮大蒜春、秋播对植物学性状及产量的影响. 李江. 2015
[13]复合肥与有机肥配合替代化肥对大蒜产量及品质的影响. 郭春倩,张广楠,李江,田洁. 2022
[14]大蒜蔗糖:蔗糖1-果糖基转移酶基因As-1-SST的克隆与表达分析. 铁原毓,田洁. 2021
[15]‘乐都紫皮大蒜’多倍体的诱导与鉴定. 张广楠,郭春倩,张祥林,田洁. 2021
[16]大蒜根尖培养诱导不定芽研究. 薛寒青,王舰,周淑兰,高霞. 2011
[17]大蒜可溶性糖积累与分配特性研究. 王丽慧,方云花,刘青元,李莉. 2014
[18]大蒜鳞茎诱导技术研究. 薛寒青. 2008
[19]大蒜果聚糖的水解方法及其定量分析. 田洁,王启璋,钟启文. 2022
[20]栽培措施对大蒜品质及其产量的影响. 刘素英. 2012
作者其他论文 更多>>
-
干旱胁迫下大蒜幼苗的代谢组学分析
作者:田洁;周倩怡;铁原毓;孙海宏;黄思杰
关键词:大蒜;干旱胁迫;代谢组学;黄酮;苯丙素
-
大蒜WRKY基因家族的鉴定与生物信息学分析
作者:隋淑梅;黄思杰;田洁
关键词:大蒜;WRKY;基因家族;表达分析;生物信息学
-
灌溉量对温室基质栽培茄子产量、品质与根区盐分积累的影响
作者:隋淑梅;刘明池;崔锦;田洁;梁浩;钟启文;季延海
关键词:基质茄子;设施蔬菜;无土栽培;营养液灌溉量;营养液供液量;根区盐分;叶片光合参数;品质;产量
-
不同播期、种瓣大小和种植密度对高原独头蒜生产的影响
作者:隋淑梅;张祥林;李屹;张广楠;韩睿;杜中平;陈生来;田洁
关键词:独头蒜;播期;种瓣大小;种植密度;独头率
-
大蒜糖转运蛋白基因AsSWEET14克隆与胁迫表达分析
作者:郑晓雯;徐庭亮;田洁
关键词:大蒜;AsSWEET14基因;基因克隆;生物信息学分析;干旱和低温胁迫
-
50份番茄品种在青海高原地区的适应性综合评价
作者:文军琴;闫超凡;邵登魁;田洁;李江;任延靖;李全辉;邓昌蓉;钟启文
关键词:番茄;变异分析;相关性分析;主成分分析;聚类分析
-
植物根际促生菌Pseudomonas putida UW4对菊花扦插苗生长及生理特性的影响
作者:田洁;唐有林;王启璋;王海滨;韩睿
关键词:菊花;扦插;促生菌;根系指标;抗氧化酶