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染色质免疫共沉淀超声波破碎条件的研究

文献类型: 中文期刊

作者: 张丽丽 1 ; 徐碧玉 2 ; 刘菊华 2 ; 贾彩红 2 ; 张建斌 2 ; 王甲水 3 ; 金志强 2 ;

作者机构: 1.海南大学

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

3.中国热带农业科学院海口实验站

关键词: 拟南芥;染色质免疫共沉淀技术;超声波破碎条件;甲醛交联

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2012 年 28 卷 30 期

页码: 208-212

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 意在找出拟南芥幼苗适宜的染色质免疫共沉淀(ChIP)超声波破碎的条件,为后期抗体的沉淀提供适当大小的片段。以拟南芥(Columbia ecotype)幼苗为材料,用1%浓度甲醛的缓冲液交联DNA和蛋白质,利用超声波将其染色质随机断裂成适当大小的片段。结果表明,适用于拟南芥幼苗的最佳ChIP试验条件为:用1%甲醛溶液交联DNA和蛋白质的复合物;用65%功率,每次工作20s,间隔4min,8次破碎该复合物,可以得到400~800bp大小的片段,用于后续的试验。经本实验的研究得到了拟南芥幼苗染色质免疫共沉淀超声波破碎的最佳条件,为后续实验奠定了基础。

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