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新疆硬粒小麦5个品种5S rRNA基因重复单元间序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 米日古丽·马木提 1 ; 吾买尔江·库尔班 2 ; 帕夏伊木·艾麦提 2 ; 赵奇 3 ;

作者机构: 1.新疆大学生命科学与技术学院新疆农业科学院核技术生物技术研究所

2.新疆农业科学院核技术生物技术研究所新疆大学生命科学与技术学院新疆农业科学院库车陆地棉实验站新疆师范大学生命科学院

3.新疆农科院粮作所

关键词: 新疆硬粒小麦;5S rDNA;NTS;进化关系;序列分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2015 年 07 期

页码: 1487-1493

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究参照Gen Bank禾本科以及前期新疆7个小麦种5S r DNA NTS序列,通过PCR技术扩增获得新疆5个硬粒小麦品种5S r DNA NTS序列,并通过与5S r RNA序列比对,得到5S r DNA NTS序列结构和边界范围。结果显示:5个硬粒小麦品种均存在两种类型5S r DNA NTS序列且相似程度不同,长NTS序列保守性较高,短NTS片段相对较低;短NTS序列存在两处序列缺失现象,两种类型NTS序列存在不同位置和程度的变异位点和变异频率。利用MEG4.0软件,采用邻接法构建了分子进化树并计算获得了品种间遗传距离。对来自不同品种克隆单元基的序列进行比对,得知对于几个组直向是存在的。直系群体的5S r DNA序列有益于硬粒小麦进一步的系统发育分析。

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