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试剂选用及带型读取方式对遗传图谱数据SSR的影响

文献类型: 中文期刊

作者: 陈浩东 1 ; 刘方 2 ; M.K.R.Khan 3 ; 蔡小彦 2 ; 王为 4 ; 王春英 2 ; 王玉红 2 ; 李育强 5 ; 王坤波 2 ;

作者机构: 1.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;湖南省棉花科学研究所/国家杂交棉研究推广中心

2.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室

3.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;Nuclear Institute for Agriculture & Biology(NIAB)

4.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室;江苏沿海地区农业科学研究所/农业部沿海盐碱地科学观测实验站

5.湖南省棉花科学研究所/国家杂交棉研究推广中心

关键词: SSR分子标记;棉花;遗传图谱;可靠性;影响因素

期刊名称: 湖南农业科学

ISSN: 1006-060X

年卷期: 2013 年 9 卷 09 期

页码: 11-14

摘要: 遗传图谱的构建是基因组研究中的重要环节,是基因定位与克隆、分子标记辅助育种的基础。遗传图谱的可靠性,直接影响到基因定位的结果,进而影响到基因的图位克隆和分子标记辅助选择的效果。在利用SSR分子标记构建棉花种间高密度遗传图谱的实验过程中,从开始PCR操作、聚丙烯酰胺凝胶检测,到群体基因型数据读取,每个实验环节都有可能导致遗传图谱数据的失真。探讨了实验过程出现的影响遗传图谱可靠性的几个关键环节及其注意事项。

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