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基于SSR荧光标记技术的玉米群体混合样本基因频率分析方法

文献类型： 中文期刊

作者： 刘晓鑫 1 ; 谢传晓 2 ; 赵琦 3 ; 路明 4 ; 曲延英 5 ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院生物技术研究中心

2.中国农业科学院作物科学研究所

3.首都师范大学生物系

4.吉林省农业科学院玉米研究所

5.AMBIOENT-中国实验室

关键词： 荧光SSR;玉米群体;混合样本;基因频率

期刊名称： 中国农业科学

ISSN： 0578-1752

年卷期： 2008 年 41 卷 12 期

页码： 3991-3998

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】建立玉米群体混合样本等位基因及其频率的分析方法。【方法】采用ABI全自动遗传分析仪,利用5′端荧光标记的SSR引物,通过混合样本中PCR扩增产物检测峰高与丰度对应,分析基因频率。【结果】与聚丙烯酰胺凝胶电泳银染法相比,ABI全自动遗传分析仪的检测灵敏度高。20个供试玉米群体中,荧光引物Phi072(6-Fam)共检测到82个等位基因位点,平均每个群体4.1个;引物Phi084(Hex)检测到43个等位基因位点,平均每个群体2.15个。多重PCR(multiplex PCR)荧光SSR检测结果显示,可以明确区分不同等位基因。荧光SSR能准确地读出片段大小,定量PCR扩增产物的丰度。用GeneScan获取数据,用Genotyper软件对数据进行设置与输出,使用R软件的FREQS-R模块,初步探讨利用荧光SSR定量化数据,计算供试群体15个单株混合样本的等位基因频率。【结论】可通过荧光SSR产物的丰度来确定混合取样群体的基因频率。

  • 相关文献

[1]春玉米叶面积系数动态特征参数及其与产量关系. 孙锐,朱平,王志敏,丛艳霞,勾玲,方立锋,赵明. 2008

[2]东北寒区肉羊新品种群FecB基因鉴定与基因频率分析. 刘学峰,张立春,李梦姝,王伟霞,佟桂芝,海龙,李信涛. 2020

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