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DNA条形码序列对不同品种美国山核桃的鉴定

文献类型： 中文期刊

作者： 陈亚辉 1 ; 朱海军 1 ; 生静雅 1 ; 张普娟 1 ; 鲍瑾 1 ; 刘广勤 1 ;

作者机构： 1.江苏省农业科学院园艺研究所

关键词： DNA条形码;美国山核桃;品种鉴定

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2013 年 29 卷 06 期

页码： 1445-1450

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 选择ITS、ITS2、psbA-trnH、matK 4条序列进行评价,以扩增及测序成功率、变异位点数和k-2-p距离等指标评价各序列的鉴定能力。此外,基于MEGA5分析不同品种美国山核桃序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果显示:不同品种美国山核桃4条序列的扩增及测序成功率扩增均为100%。不同品种的ITS2和psbA-trnH序列一致性为100%,而ITS和matK序列的一致性分别为99.32%和99.95%,两者均存在较多的变异位点,可以有效地区分美国山核桃不同品种。因此,ITS和matK序列可以作为鉴定美国山核桃不同品种的优势条形码组合。

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