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茶树硒代半胱氨酸甲基转移酶基因生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘声传 1 ; 鄢东海 1 ; 魏杰 1 ;

作者机构： 1.贵州省茶叶研究所

关键词： 茶树;CsSMT基因;生物信息学

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2013 年 26 卷 06 期

页码： 2221-2226

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为揭示茶树(Camellia sinensis)硒代半胱氨酸甲基转移酶(Selenocysteine methyltransferase,SMT)基因CsSMT的生物学功能及其分子调控机理,利用生物基因组学数据库和生物信息学分析软件,对CsSMT进行生物信息学分析,预测该基因编码产物的理化性质、结构与功能,同时构建CsSMT同源基因的系统进化树。结果表明:CsSMT基因cDNA全长1368 bp,开放阅读框位于50~1105 bp处。编码产物为稳定的亲水性蛋白,分子式为C1670H2645N459O532S15,无跨膜结构,无信号肽,定位于细胞质基质。二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主,三维建模成功。系统进化分析表明,CsSMT基因mRNA与拟南芥同型半胱氨酸S-甲基转移酶基因(Homocysteine S-methyltransferase,HMT)聚为一组。

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