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富集优势基因型的后备亲本筛选以及相关分子标记的遗传效应分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张成锋 1 ; 苏胜彦 1 ; 朱健 1 ; 石连玉 2 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

2.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 黄河鲤新品系;基因型;体重;关联分析;上位效应

期刊名称: 水生生物学报

ISSN: 1000-3207

年卷期: 2017 年 41 卷 01 期

页码: 79-85

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 选取黄河鲤新品系亲本和子代共450尾,5对微卫星引物和4个基因区段扩增引物开展基因型检测,并检测它们与体重的关联性以及分析相应的遗传效应。结果显示:Koi42和4个SNPs位点对体重有显著的影响,获得具有超过富集2个优势基因型的候选亲本共13尾,富集优势分子标记基因型的候选亲本生长性能优势明显。通过多元逐步回归分析,利用AIC最佳模型筛选到COⅠ626、D-Loop253和Koi42共3个位点,发现Koi42贡献率较大,经Fisher精确性检验,发现其与性别存在关联,其加性效应接近显著水平(P<0.05)。检测的多个上位效应组分中,仅有D-Loop253和Koi42的加性效应间的互作达到显著水平。对遗传方差组分进行剖分发现,加性方差占11.4%,两个位点的加性效应构成的上位效应占到77.5%,因此这3个分子标记对体重的影响主要以上位效应为主,而且是两两加性效应的占比较大,可以推断出D-Loop 253和Koi42两个分子标记的上位效应起主要作用。综上所述结果提示Koi42及与其有互作的D-Loop253可用于黄河鲤新品系的标记辅助选择,可以开展多个分子标记的富集选择。

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