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大肠杆菌Top10Na~+/H~+反向运输体A基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 麻鹏达 1 ; 周磊 1 ; 李毅丹 1 ; 谭化 1 ; 刘艳芝 1 ;

作者机构： 1.吉林省农业科学院生物技术中心

关键词： 大肠杆菌Top10;Na+/H+反向运输体基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 吉林农业科学

ISSN： 1003-8701

年卷期： 2008 年 33 卷 06 期

页码： 25-29

收录情况： CSCD

摘要： 根据细菌中存在的Na+/H+反向运输体(Na+/H+antiporterA,nhaA)的基因序列,采用PCR扩增的方法从大肠杆菌(Escherichia coli)Top10中克隆到了nhaA基因(Acession Numeber:EU368045)。nhaA开放阅读框为1 167 bp,编码含有388个氨基酸残基,分子量为41.3 kDa的蛋白,预测等电点为9.23。nhaA含有25个碱性氨基酸,19个酸性氨基酸,211个疏水氨基酸及63个极性氨基酸。二级结构预测表明,该蛋白含约50%的α-螺旋、18%的延伸链、7%的β-转角和25%的不规则卷曲。亲疏水性分析显示,nhaA是疏水性蛋白。跨膜结构进行分析显示该蛋白含有11个跨膜区域。序列分析表明,大肠杆菌Top10 nhaA基因与大肠杆菌DH5α、大肠杆菌HS、大肠杆菌SECEC SMS-3-5和大肠杆菌CFT073的nhaA基因同源性分别为100%、98%、95%和92%。大肠杆菌Top10 nhaA基因的克隆及生物信息学分析为今后对nhaA的进一步深入研究奠定了基础。

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