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工业大麻WRKY家族全基因组鉴定及生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 张元野 1 ; 张利国 1 ; 张明 1 ; 房郁研 1 ; 郑楠 1 ; 闫博巍 1 ; 隋月 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院经济作物研究所

关键词: 工业大麻;WRKY;蛋白理化性质;同源性分析;生物信息学

期刊名称: 黑龙江农业科学

ISSN: 1002-2767

年卷期: 2024 年 010 期

页码: 17-26

摘要: WRKY转录因子是一类具有多种生物学功能的基因,工业大麻中WRKY家族研究较少.本研究使用拟南芥WRKY家族蛋自序列与工业大麻全基因组进行比对,鉴定到34个WRKY家族成员,不均等分布于9条染色体上,同时可分为Group Ⅰ、Group Ⅱa~Group Ⅱe、Group Ⅲ共7个亚族,其中Group Ⅰ亚族成员数量最多,数量为11个;CsWRKY15包含的结构域最多、CsWRKY34启动子区域的顺式作用元件最多,二者可能行使着较多生物学功能;工业大麻WRKY家族与拟南芥、水稻、玉米、大豆及大麻自身间共线性分析显示,CsWRKYs存在丰富的直系同源基因进化关系.

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