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基于PCR-SSR的棉花外源染色体片段快速检测方法的建立与应用

文献类型: 中文期刊

作者: 宿俊吉 1 ; 陈红 2 ; 邓福军 2 ; 马麒 2 ; 庞朝友 3 ; 吴嫚 3 ; 王成社 4 ; 喻树迅 3 ;

作者机构: 1.西北农林科技大学农学院;新疆农垦科学院棉花研究所/农业部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室;中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室

2.新疆农垦科学院棉花研究所/农业部西北内陆区棉花生物学与遗传育种重点实验室

3.中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室

4.西北农林科技大学农学院

关键词: 海岛棉;陆地棉;染色体片段;SSR;置换系

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2014 年 22 卷 05 期

页码: 108-117

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 外源染色体片段或基因的准确鉴定对作物遗传改良具有重要的作用。尽管分子标记已被广泛应用到外源染色体片段或基因的检测上,但是对于大群体中少数几个阳性植株的鉴定,逐个检测的效率极低。本研究以陆地棉(Gossypium hirsutum L.)新陆早48号与海岛棉(G.barbadense)染色体片段置换系CSSL-122的BC2F1群体147单株DNA样本为材料,通过构建二维矩阵排列DNA样本材料,分别对待测样本按行、列进行混合,获得m个行的混合样本和n个列的混合样本;以m=n=8矩阵为例,对待检m×n=64个样本行列混合获得16个混合样本并进行检测,根据检测结果在矩阵中推断确定含有外源染色体片段的阳性样本。结果表明,利用基于PCR-SSR技术构建矩阵混合池的检测方法,可以快速检测陆地棉背景中外源海岛棉染色体片段,逐个样本检测验证了其方法的准确性;统计学分析表明,阳性样本出现频率低于7.81%时,检测样本的节本率可保持在50%以上。基于PCR-SSR技术构建矩阵混合池检测方法的建立,为棉花外源染色体片段快速高效鉴定提供了新方法。

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