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脊尾白虾3个野生群体线粒体COI基因的遗传多样性及其系统发育分析

文献类型： 中文期刊

作者： 马朋 1 ; 刘萍 2 ; 李健 2 ; 李吉涛 2 ; 陈萍 2 ;

作者机构： 1.大连海洋大学

2.农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室/中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 脊尾白虾;野生群体;COI基因;遗传多样性;系统进化

期刊名称： 渔业科学进展

ISSN： 1000-7075

年卷期： 2011 年 32 卷 06 期

页码： 50-56

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR扩增技术对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾的3个野生群体共计62个个体的线粒体COI基因片段进行扩增和测序,获得长度为658bp核苷酸序列。62条序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为31.53%、22.63%、27.30%、18.53%和58.83%,A+T含量显著高于G+C含量,这一结果与甲壳类、双壳贝类等的COI线粒体基因片段中的观察结果相似。通过统计变异位点、核苷酸多样性指数和平均核苷酸差异数进行基因序列变异分析。AMOVA分析表明,3群体间总遗传分化系数Fst=0.3611(P<0.01),群体间存在较高的遗传分化,其中象山湾群体与莱州湾群体之间的遗传分化系数最高,莱州湾群体与海洲湾群体之间的遗传分化系数最低。另外用MEGA4.0软件中的NJ法构建分子进化树,同时由NCBI下载同源序列,探讨了长臂虾亚科几个种的系统进化关系,用NJ法构建的系统树显示,脊尾白虾不同单倍型先与长臂虾属和小长臂虾属聚为一支,然后与沼虾属聚为一支。

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