您好,欢迎访问中国水产科学研究院 机构知识库!

刺参TRAF7基因克隆及其响应高温胁迫下的表达特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵岩峰 1 ; 廖梅杰 2 ; 葛建龙 2 ; 王锦锦 2 ; 王印庚 2 ; 荣小军 2 ; 李彬 2 ; 谭颜廷 2 ;

作者机构: 1.上海海洋大学水产与生命学院

2.中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业与可持续发展重点实验室

关键词: 刺参;TRAF7;高温胁迫;基因克隆;表达特征

期刊名称: 渔业科学进展

ISSN: 2095-9869

年卷期: 2025 年 46 卷 001 期

页码: 149-160

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 肿瘤坏死因子受体相关因子7 (tumor necrosis factor receptor associated factor 7, TRAF7)作为一种细胞内蛋白,参与信号转导,并介导宿主应激防御调控过程。为研究TRAF7在刺参(Apostichopus japonicus)高温胁迫中的作用,本研究利用c DNA末端快速扩增技术(RACE)和实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR),克隆了刺参TRAF7(Aj TRAF7)全长c DNA序列,分析了其结构特征和在基因组中的分布,并检测了该基因在刺参不同组织和高温胁迫过程中体壁组织中的表达变化情况。结果显示,AjTRAF7全长2 576 bp,开放阅读框(ORF)长1 770 bp,5'UTR长345 bp,3'UTR长461 bp,编码589个氨基酸,预测蛋白分子量为65.6 kDa,理论等电点(p I)为7.52。蛋白序列包含1个RING finger结构域、1个Coiled coil结构域和6个WD40结构域,N端包含1个螺旋区域。该基因预测蛋白包含41个丝氨酸磷酸化位点、20个苏氨酸磷酸化位点和3个酪氨酸磷酸化位点,蛋白N端具有3个天冬酰胺糖基化位点。刺参基因组中比对到2个AjTRAF7基因拷贝,第一个拷贝包含18个外显子和15个内含子,第二个拷贝包含17个外显子和14个内含子。系统进化学分析表明,刺参TRAF7氨基酸序列与蝠海星(Patiria miniata)和紫色球海胆(Strongylocentrotus purpuratus)相似性较高,分别为40.58%和38.37%,刺参与蝠海星和紫色球海胆聚在一支。RT-qPCR结果显示,Aj TRAF7在健康刺参各组织中均有表达,其在雌性性腺中表达量最高,体腔细胞中表达量次之,在呼吸树、体壁、肠道、雄性性腺和纵肌中表达量依次降低,各组织间表达量差异显著(P<0.05)。在响应高温胁迫的过程中,与对照组相比,体壁组织中AjTRAF7基因表达量在第2天和第4天显著上升(P<0.05),第6天基因表达开始下降。综上,AjTRAF7基因可能参与刺参应对高温胁迫的表达调控过程,相关结果将为解析刺参应对高温胁迫的分子机制提供科学依据。

  • 相关文献

[1]中华鳖Wnt4基因克隆及表达分析. 张英萍,凌晨,王利华,沙航,邹桂伟,胥焘,罗相忠,梁宏伟. 2020

[2]黄颡鱼生长抑素基因的克隆及表达谱分析. 梁宏伟,曹磊,李忠,邹桂伟. 2015

[3]黄条鰤MSTN基因的克隆及其在早期发育中的表达特征. 史宝,曹亚男,柳学周,孙冉冉,徐永江,王滨,姜燕. 2021

[4]魁蚶(Scapharca broughtonii)血红蛋白Ⅰ基因克隆及表达特征. 赵庆,吴彪,刘志鸿,孙秀俊,周丽青,杨爱国,张高伟. 2019

[5]中华鲟热休克蛋白hsp30基因cDNA的克隆及其在高温胁迫下的表达分析. 司凯歌,江南,张海耿,周勇,刘文枝,曾令兵,倪琦,范玉顶. 2019

[6]碱胁迫对三种罗非鱼atic基因表达的影响. 苏换换,朱华平,刘志刚,高风英,卢迈新. 2020

[7]杂交鲟"鲟龙1号"(Huso dauricus♀*Acipenserschrenckii♂)atp1α1与atp1β1基因的克隆、序列分析及碱胁迫下鳃的表达特征. 杨合霖,刘霞飞,张颖,吕伟华,王念民,丰超杰,徐伟,曹顶臣. 2023

[8]大鲵热应激同源蛋白70基因cDNA克隆及表达分析. 孟彦,肖汉兵,田海峰,胡乔木. 2014

[9]刺参体腔液穿刺抽取后细胞恢复过程的初步研究. 廖梅杰,王印庚,郝志凯,荣小军,陈贵平,陈霞. 2009

[10]刺参机械去脏工艺的实验研究. XU Wen-qi,徐文其,SHEN Jian,沈建. 2008

[11]渡夏期养殖刺参腐皮综合征的发生与环境因子间的关系. Huang Huawei,黄华伟,Wang Yingeng,王印庚,Chen Xia. 2011

[12]几种常用饵料对稚幼参生长影响的初步研究. Zhu Jianxin,朱建新,Liu Hui. 2008

[13]刺参池塘底栖真核生物群落DNA指纹结构与环境理化因子的关系. 荣小军,李彬,廖梅杰,张正,王印庚,陈贵平. 2009

[14]刺参体壁氨基酸组成的季节变化. 高菲. 2008

[15]刺参池塘养殖青苔防治方法. 张传涛,赵炳然,曹金凤,孙祥山. 2016

[16]裂壶藻对刺参生长、免疫及消化酶的影响. 黄亮华,李浩洋,李彬,廖梅杰,陈骏佳,班甲,荣小军,李强,王印庚. 2014

[17]养殖刺参“腐皮综合征”致病菌——灿烂弧菌的原位杂交检测方法的建立与应用. 王印庚,荣小军,张凤萍,王岚,廖梅杰,邹安革. 2013

[18]应用PCR方法检测刺参腐皮综合征病原——灿烂弧菌. 张凤萍,王印庚,李胜忠,荣小军,廖梅杰,张正. 2008

[19]仿刺参微卫星标记的筛选及群体遗传结构分析. 潘传燕,臧云鹏,廖梅杰,王印庚,荣小军,张正,李彬,陈贵平. 2012

[20]高温暴雨时节莱州湾沿岸刺参池塘养殖技术要点. 曹金凤,张传涛,赵炳然,孙祥山,宁晨洁,黄经献. 2016

作者其他论文 更多>>