文献类型： 中文期刊

作者： 李渊 ¹ ; 徐黎明 ² ; 赵景壮 ² ; 刘淼 ² ; 任广明 ² ; 尹家胜 ² ; 纪锋 ² ; 卢彤岩 ³ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院

2.;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院

3.;中国水产科学研究院黑龙江水产研究所;上海海洋大学水产与生命学院;

关键词： 鲤疱疹病毒3型;进化分析;流行病学;B细胞抗原表位;预测

期刊名称： 淡水渔业

ISSN： 1000-6907

年卷期： 2017 年 04 期

页码： 37-43

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 2015-2016年对来自黑龙江地区46个养殖场送检的鲤鱼进行锦鲤疱疹病毒(Koi herpes virus,KHV)的分离鉴定,并应用DNAStar等软件对检出的阳性样本的主要囊膜蛋白(Major envelop protein,MEP)基因进行生物信息学分析。结果显示,KHV的检出率约为6.5%,3株阳性样本具有相同的MEP基因序列,称之为KHV-HLJ1516。MEP基因开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸,相对分子质量为28 280.58,等电点为8.40。对KHV-HLJ1516的MEP基因序列同源性分析表明,其与KHV-GZ11分离株仅有1个碱基不同,但并未导致氨基酸发生改变,碱基相似性为99%;而与HZ419分离株相比,KHV-HLJ1516的MEP基因有3个碱基发生突变,相应的氨基酸由Asn变为IIe。聚类分析结果显示,KHV-HLJ1516与KHV-GZ11处于同一分支,而HZ419位于另一分支。B细胞抗原表位预测结果显示,KHV-HLJ1516的MEP的抗原表位主要位于4~11,24~40,42~63,82~110,209~218,238~249氨基酸区段。