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部分柿属植物TRAP标记反应体系的建立与引物筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 罗纯 1 ; 吴迪 1 ; 张青林 1 ; 罗正荣 1 ;

作者机构: 1.华中农业大学

关键词: 柿属植物;TRAP;反应体系优化;引物筛选

期刊名称: 江西农业学报

ISSN: 1001-8581

年卷期: 2014 年 09 期

页码: 1-5

摘要: 为了建立柿属植物目标区域扩增多态性(TRAP)标记技术体系,对影响TRAP-PCR的Mg2+、dNTPs、Taq DNA聚合酶、固定引物和随机引物浓度比5个因素进行了优化。确定优化的反应体系为:模板DNA 40 ng,buffer 1×,Mg2+1.4 mmol/L,dNTPs 0.2 mmol/L,固定引物和随机引物浓度比为11∶1,Taq酶0.5 U,反应总体积为15μL。利用柿属植物EST数据库信息设计锚定引物10条,与11条随机引物组合共110对引物。利用这些引物对柿属植物6个基因型进行TRAP-PCR扩增,其中84个引物组合能扩增出清晰条带,占引物总量的76.36%;36个引物组合表现出良好的多态性扩增,并在20份柿属植物中进行了引物验证。

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