文献类型： 中文期刊

作者： 陈伟 ¹ ; 李志卫 ¹ ; 玉山江·麦麦提 ¹ ; 聂园军 ¹ ; 李亚娟 ¹ ; 赫娟 ¹ ; 柴敏 ¹ ; 罗永平 ¹ ;

作者机构： 1.山西师范大学生命科学学院;新疆农业科学院植物保护研究所/农业部西北荒漠绿洲作物有害生物综合治理重点实验室;山西农业大学;铜仁市农业科教信息站

关键词： 草莓斑驳病毒;cp基因;遗传多样性

期刊名称： 西北农业学报

ISSN： 1004-1389

年卷期： 2023 年 32 卷 012 期

页码： 2007-2013

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 旨在研究草莓斑驳病毒(SMoV)在山西省的分布、结构变异及遗传多样性.从山西省7个主要草莓种植区随机采取159份草莓叶片进行RT-PCR病毒检测,结合在线数据库,使用MEGA5构建系统发育树,采用SDTv 1.2软件进行序列相似性分析,运用DnaSP v5.10软件分析cp基因的遗传多样性,采用RDP v.4.31软件检测SMoV中的重组事件.RT-PCR检测后发现,从山西省各地区收集的159份草莓叶片中有65份样品呈阳性,检出率为38.46%.这些阳性样品经过分离、测序、克隆,获得16个SMoV分离物.结合在线的19个SMoV分离物系统进化树分析显示,35个SMoV分离物被分成两组,组1包含28个分离物,均来自中国;组2包含7个分离物,分别来自加拿大、日本和美国.经选择压分析和中性检验,组1和组2 SMoV分离物之间存在显著的遗传差异,且中性检验均为负值,SMoV种群呈扩张状态.序列相似性分析表明,35株分离物的核苷酸同一性为81.34%~100%,氨基酸的一致性为94.77%~100%,呈现出较高的相似性.可见:SMoV存在较高的遗传变异,负选择压力可能是导致SMoV遗传多样性的原因.