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海南黑山羊小分子热休克蛋白9cDNA克隆及其生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 施力光 1 ; 曹婷 1 ; 侯冠彧 1 ; 周汉林 1 ; 黄显洲 1 ; 荀文娟 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词： 小分子热休克蛋白9;海南黑山羊;cDNA克隆;生物信息学分析

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2013 年 40 卷 10 期

页码： 56-60

收录情况： 北大核心

摘要： 本研究以海南黑山羊睾丸组织为材料,利用RT-PCR和RACE技术获得海南黑山羊小分子热休克蛋白9(small heat shock protein 9,Hspb9)基因完整的CDS序列,并对其进行生物信息学分析。结果表明,克隆得到山羊Hspb9cDNA长549bp,CDS区471bp,共编码157个氨基酸,提交至GenBank数据库中,登录号为:JX088726。生物信息学分析结果表明,Hspb9编码的蛋白无跨膜区和信号肽,存在多个磷酸化位点;预测Hspb9蛋白二级结构α-螺旋占15.28%,β-折叠占30.57%,无规则卷曲占54.15%;存在1个UBQ结构域;Clustel W方法比对山羊Hspb9与绵羊、牛的同源性最高。

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